
近日,合肥医科上大学首位附加门诊王学浩院土团队合作在Cancer Letters上发表了“O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma”的研究论文。该研究建立了一个涉及YBX1糖酵解和H3K18乳酸化的正反馈循环,从而加速了HCC的进展。破坏这种反馈循环可能为HCC提供一种新的治疗策略。拜谱生物为该研究提供了转录组测序,球蛋白互作组和靶向疗法能力代谢率检测分析服务。
用英文怎么说主题:O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma(Cancer Letters IF:10.1)
英文版名称:YBX1的O-乙酰葡糖胺化修饰驱动肝细胞癌中糖酵解-组蛋白乳酸化反馈环路
企业工作单位:南京医科大学
钻研材质:细胞
拜谱出具服务于:转录组测序+蛋白质互作组+靶向治疗精力分解组
科技途径:
理论研究报告单
01、YBX1被签别为HCC中糖酵解的重要的人类基因
本探讨收集HCC恶性淋巴良性肉瘤样板(n=7)的单細胞RNA测序统计资料集进行探讨,表明糖酵解灵活性具体聚焦在恶性淋巴良性肉瘤細胞中,hdWGCNA探讨鉴别出9个遗传基因控制模块(图1A-G)。TCGA-LIHC链表的环境探讨明确YBX1为独有环境分险的因素(图1H)。进两步根据IHC、WB科学实验和恶性淋巴良性肉瘤聚集与周围非恶性淋巴良性肉瘤聚集的余地转录组学统计资料集得知YBX1是肝細胞癌诊疗的因素靶点(图1I-K)。
图1:YBX1被敲定为调HCC组织糖酵解的重中之重基本要素
02、YBX1带动HCC中的有氧糖酵解和繁衍
为了研究YBX1在调控HCC糖酵解中的作用。构建YBX1敲低细胞系,靶向疗法动能分解代谢组学检测,敲低后糖酵解途径的几个关键中间体显著减少,三羧酸(TCA)循环中间体的水平也降低了(图2A-D);结合葡萄糖碳示踪法、细胞外酸化率检测等实验证实YBX1敲低后,糖酵解活性受损,葡萄糖摄取和乳酸分泌减少,抑制HCC细胞增殖(图2E-K)。
图2:YBX1增强HCC中的有氧糖酵解和增值能力
03、OGT与YBX1结合起来并加快YBX1的O-GlcNAc糖基化
为了识别YBX1的调控因子,球蛋白互作组分析显示YBX1与O-GlcNAc转移酶(OGT)相互作用,并结合Co-IP和共定位进行验证(图3A–E)。进一步创建了一个OGT K908A突变体,利用O-GlcNAc糖基化激活剂、抑制剂OSMI-1判断YBX1的O-GlcNAc糖基化的变化(图3F-H),结构域分析OGT的TPR结构域对于与YBX1的结合至关重要(图3I-L)。免疫沉淀YBX1的质谱分析揭示了六个潜在的O-GlcNAc糖基化位点,并结合点突变和分析证实T57是YBX1上关键的O-GlcNAc糖基化位点(图3M-O)。
图3:OGT与YBX1紧密联系并提高网站YBX1的O-GlcNAc糖基化
04、YBX1的O-GlcNAc糖基化改善其磷碱化,然后推进其核转位
进三步检验YBX1的O-GlcNAc糖基化什么情况下不良影响其磷酸性反应,在OGT敲低的HCC肿瘤细胞膜中或用OGT调控剂OSMI-1外理,YBX1核蛋清总体能力偏态大幅度降低,YBX1磷酸性反应偏态减掉(图4A-C)。IP进行实验现示,在一致的Flag-YBX1底物总体能力下,YBX1-WT的磷酸性反应总体能力偏态低于YBX1-T57A,认为磷酸性反应的提高这并非是是如果高的YBX1核蛋清描述(图4D)。分开了核和质类物质发展TMG外理的HCC肿瘤细胞膜中YBX1核描述的提高(图4E-F),进三步发展YBX1磷酸性反应的重点改善因素是AKT(图4G-I)。此类发展推崇O-GlcNAc糖基化能够 驱动其磷酸性反应来改善YBX1核蛋清安全稳确定并驱动核转位。
图 4.YBX1的 O-GlcNAc 呈现有效于其进的一步发生的磷硝化作用呈现并才能促进会其核转位
05、YBX1有利于PKM2转录
前期结果表明YBX1 O-GlcNAc糖基化通过增强糖酵解和细胞增殖促进HCC进展。为了研究YBX1如何调控糖酵解,我们在HCC细胞中进行了转录组测序分析,糖酵解相关基因集在YBX1敲低细胞中显著抑制(图5A-B)。RNA 测序数据和 CUT&Tag 数据集以及ChIP-qPCR、QRT-PCR 分析表明PKM2 和 LDHA 是 YBX1 的直接转录靶标(图5C-H)。
图 5.YBX1驱动PKM2转录
06、YBX1 才可以增强组蛋清乳碱化装饰水准
学习发现了YBX1敲低有明显大幅度较低蛋清质乳过酸,尤为是H3K18乳过酸(图6A-C)。糖酵解仰制作用剂2-DG的实验报告确认了糖酵解与组蛋清乳过酸的之间联系,仰制作用糖酵解可有明显大幅度较低H3K18la平均水平(图6D)。PKM2过表明可逆反应转YBX1敲低而致的H3K18la下跌,以外源乳酸操作实际上的提升H3K18la,还陪伴YBX1表明上涨,提示信息会存在双向反应(图6E-G)。CUT&Tag与ChIP-PCR确认,H3K18la按照丰度于YBX1开机子之间促进会其转录,该环节受O-GlcNAc糖基化管控(图6H-J),高并发现了P300 上涨是YBX1促进H3K18乳酰化做用的机制化(图6K-L)。
图6.YBX1资料H3K18乳酸性反应呈现级别
经典文章工作小结
在一项研究分析中有关资料了YBX1在HCC中高表达方式出来,还有与糖酵解谜切相应。YBX1在T57处被O-GlcNAc装饰,因而平稳球淀粉酶质含量并加大其表达方式出来。类似这些装饰还提高YBX1在T57处的磷酸性反应,提高其核易位。由此,一项的时候怎强了糖酵解相应人类染色体的转录并激励乳酸的有。最后,YBX1启用P300的转录,行而能够组球淀粉酶的乳酸性反应,特备是H3K18la,H3K18乳酸性反应正方向调节作用YBX1人类染色体转录(图7)。
图7.Y糖酵解-表观遗传的正反两面馈环规则图
拜谱总结
本研究结合了单细胞转录组、空间转录组的数据,利用转录组、蛋白互作组、代谢组以及多种分子实验揭示了一个YBX1-糖酵解-H3K18la 的反馈回路,驱动HCC进展,并提示针对HCC代谢的潜在治疗策略。拜谱菌物为该研究提供了转录组测序,蛋清互作组和靶点能量是什么分解代谢组技术服务,拜谱生物体建立了完善成熟的转录组学、血清组学、全文翻译后修饰语组学、分解组学以及多组学联合产品技术服务体系,助力发表高分文献,欢迎致电咨询!
考虑学术论文
Ji Y, Xu Z, Tang L, Huang T, et,al.. O-GlcNAcylation of YBX1 drives a glycolysis-histone lactylation feedback loop in hepatocellular carcinoma. Cancer Lett. 2025 Oct 28;631:217957. doi: 10.1016/j.canlet.2025.217957. Epub 2025 Jul 26. PMID: 40721081.