草酸钙（CaOx）肾结石是泌尿体统性最喜欢见的重大疾病中的一种。肾机构中CaOx硫化锌过饱满堆积会造成的肾小管肿瘤细胞直接损伤和凋亡，然而造成的肾结石的构成。短链皮脂酸由肠腔内厌氧反应器革兰氏阴性菌厌氧发酵伙食合成纤维生成，不在局布肠腔障壁中产生效应，然而在体统性情况上也产生的关键效应。在这其中，丁酸是最极为丰富的短链皮脂酸，享有免役仰制和免役仰制效应,本设计刍议丁酸对CaOx肾结石的效应名词解释暗藏靶点。

围绕草酸钙肾结石相关机制研究，华山医院专家泌尿整形外科吴忠先生、周子健硕士于今年5月在Chem Biol Interact发表了相关成果，7月4日该团队又有一篇新作发表。吴忠教导、周子健医生在Food and Chemical Toxicology（IF=4.3）上发表题为“Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9”的研究文章。研究人员发现丁酸在体外和体内均能抑制CaOx肾结石模型的氧化应激和炎症损伤，并利用网络药理学预测发现CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的靶基因，最后通过细胞实验证实CYP2C9在草酸诱导的HK-2细胞损伤模型中的作用。拜谱生物制品与吴忠教授、周子健博士团队再次合作，提供了线上药学学保障，助力预测CYP2C9是丁酸影响CaOx肾结石的潜在靶点，为丁酸预防CaOx肾结石产生的临床应用奠定理论基础。

论文公司名称：Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9（Food Chem Toxicol.，IF=4.3，2023.07） 客人组织：华山醫院 科学研究客体：大鼠、HK-2组织 排序数据信息：照表组（Con）、类别组（Model）和丁酸钠组（NaB） 拜谱提拱技术工艺：网洛药学学验测

方法注意事项图

学习可是

钻研人员管理前提建立大鼠沙盘模特，使用生理问题生物化学评价指标和组织安排病症学固色等钻研方法挖掘丁酸可以削减CaOx沙盘模特大鼠肾CaOx尖晶石的建成和问题，提升CaOx沙盘模特大鼠的宫颈炎症问题和硫化材质的无限表达出。与此同时，丁酸还可减缓草酸诱惑的HK-2体细胞膜问题、硫化应激状态和体细胞膜凋亡。 为探究式丁酸组成和靶DNA网，的研究考生从PubChem得到 丁酸和丁酸酯的二维和二维组成（图1A）。顺利通过PharmMapper统计的数据源库和Uniprot统计的数据源库治理后共选择出116个丁酸靶DNA供进几步具体剖析。将DNA汇总使用STRING统计的数据源库，对其进行PPI网具体剖析。Cytoscape做出了顺序排列的前20的联络线靶DNA的详细完整网图，收录CYP2C9、CASP3、MAPK14、ALB、HRAS、ABL、RARA、RARG、RXRB、PRKACA、NOS3、SRC、MMP9、KDR、HSP90AA1、HPGDS、GSTA3、GSTA1、GSR和GSTM2（图1B）。以下联络线DNA与网中的各种DNA均的表现出一段的有关于性，反映以下DNA将会利用着协同作战影响。GO和KEGG具体剖析蕴含了丁酸联络线DNA的有关于条件和菌物学基本功能（图1C）。联络线DNA一般的与类固醇刺荷尔蒙回应、脱色应激状态性回应、几丁质酶氧生殖细胞对类固醇刺荷尔蒙条件刺激的反馈或对酸碱性无机化学有机化合物的反馈有关于。上述情况经验，以下联络线DNA一般的参与性了脱色应激状态性和对几丁质酶氧的菌物反馈进程，是肾结石建成机理中至关必要的条件，这阐明丁酸将会在肾结石中利用必要影响。

图1| 丁酸结构类型与靶遗传基因互联网浅析(图源：Zijian Zhou., et al., Food Chem Toxicol.

为进的一步探索世界丁酸对CaOx肾结石或许切靶表观遗传组，探索方案相关内容联内容专业人工用GEO数据报告展现库对GSE73680中的健康比较与CaOx肾结石朋友的表观遗传组区别参与了探索方案。比较组与CaOx结石朋友的明显性区别传达表观遗传组（DEGs）肿瘤筛查规则为P < 0.05、|log2(FC)| > 1。共需求到3783个表观遗传组发现明显變化，在这其中3379个（89.4%）表观遗传组传达调涨，404个（10.6%）表观遗传组传达再降（图2A）。对DEGs参与聚类算法解析法解析，热图展现了前10个被选中DEGs的二维层次聚类算法解析法特征英文（图2B）。继而，探索方案相关内容联内容专业人工根据GeneCards数据报告展现库人工成本签定了370个也许与CaOx肾结石相关内容联内容的表观遗传组，排明前20位的予测表观遗传组下列不属于相关内容联内容性评估就像文中2C图示。是为了选择丁酸医疗CaOx肾结石的要素靶点，探索方案相关内容联内容专业人工将PharmMapper中的丁酸靶点、GEO中的DEGs和GeneCards中的CaOx肾结石相关内容联内容表观遗传组处置赢得好几个个Venn图。终极，CYP2C9被确立为丁酸后果CaOx肾结石的暗藏靶点(图2D)。前者，探索方案相关内容联内容专业人工还参与了丁酸与CYP2C9的原子核连通，CYP2C9的6个胺基酸残基ASN-474、LYS-48和GLY-46与丁酸间接效用，氢键能为4.2 kcal/mol（图2E）。 在合理利用网洛临床药理学分析CYP2C9是丁酸直接影响CaOx肾结石的靶遗传基因后，探讨的人员还使用肿瘤体细胞工作否认了CYP2C9可大幅度降低草酸诱导性的HK-2肿瘤体细胞的ROS平均水平、炎症病变板材损害和凋亡。

图2| 半数以上据库连合具体分析預測CYP2C9是丁酸帮助于CaOx肾结石的靶基因组

设计没想到

本探讨一方面取决于了丁酸在身体之外和身体里均能可以促使作用CaOx肾结石绘图的氧化物反应应激性状态和细菌感染断裂，随后不久按照网上临床药理学学选择有丁酸的影响CaOx肾结石的存在靶点——CYP2C9，还有按照内部实验操作取决于CYP2C9在草酸盐诱导型的HK-2内部ROS关卡、细菌感染断裂和凋亡。某些取决于了取决于丁酸可以按照可以促使作用CYP2C9来可以促使作用CaOx肾结石的氧化物反应应激性状态，降低细菌感染断裂。哪一期间中拜谱海洋生物工程保证了网上临床药理学学能力服務，再者拜谱海洋生物工程可提升心智成熟加强制度建设的基因组组学、蛋清质组学、产生组学等几组学功能及能力服務，喜欢致电的方式顾问！ 参考价值文章：Zhou Z, Zhou X, Zhang Y, Yang Y, Wang L, Wu Z. Butyric acid inhibits oxidative stress and inflammation injury in calcium oxalate nephrolithiasis by targeting CYP2C9. Food Chem Toxicol. 2023 Aug. doi: 10.1016/j.fct.2023.113925.