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HEATag:单细胞测序样本标记新方法,低成本、跨物种、全平台兼容!

发布时间:2025-11-10

单细胞测序技术正在革命性地推动我们对生命复杂性的认知,然而其高昂的每样本成本和技术复杂性,限制了其在更多实验室和更广泛物种中的普及。尽管多重样本标记技术能有效“降本增效”,但现有的方法往往受限于抗原鱼类特异形、寡核苷酸突显直接费用过高或的操作具体操作复杂的。近日,南方海洋科学与工程广东实验室(广州)的陈凯教导开发团队在Journal of Genetics and Genomics上发表了一项创新性方法学研究,提出了一种名为HEATag的新型样本标记策略,为我们提供了一个低的成本、跨植物物种、全平台网站兼容的全新解决方案。

杂志期刊详细资料

Journal of Genetics and Genomics (JGG)是由我国的专业院基因基因与健康发育菌物学探究所和我国的基因基因自学牵头的国际联盟学界杂志,秉承于通讯稿人的一生专业和临床基因基因学业务教育行业的原汁原味性探究成功。JGG 2026年度影晌细胞因子7.1,Scopus学界杂志好评指标体系CiteScore 9.9,位居JCR 2026年度GENETICS & HEREDITY业务教育行业Q1区(Top 10%),BIOCHEMISTRY & MOLECULAR BIOLOGY业务教育行业Q1区,位居我国的专业院杂志区域菌物学学科门类1区(Top杂志),基因基因学和动物化学与原子菌物学小类双1区。

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些是啥HEATag

精妙的“二一体化”方案

HEATag是由凝集素和HUH内切酶涉及的相融蛋清

「品牌定位器」方案 - 凝集素

能够识别细胞膜上广泛存在且高度保守的糖基化修饰语(如GlcNAc和Neu5Ac)。

「拼接器」模组 - HUH内切酶

可以序列特异性地与普通的、无需化学修饰的单链DNA(ssDNA)引索长形码实现共价对接。

“1+1>2”的使用效果:将两者融合,得到的HEATag蛋白既能通过凝集素牢牢锚定在细胞膜上,又能通过HUH蛋白携带特定的DNA条形码进行范例标出与可追溯。

Fig1: HEATag多个图标道理关心图

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实际的产品检验

HEATag到达 有多用打?

就可以在有差异具体条件下,完成辅乳期食草动物肿瘤人体细胞系单肿瘤人体细胞混样测序

实验室里的设计再精妙,也要经过真实样本的 “实战考验” 才算数。论述销售团队为 HEATag 快速设置了多轮 “负压测验”,从神经细胞系系到神经细胞系核,从干燥到恒温,从新鲜样表到稳固样表,全方向位置安全验证它的固确定和可信性。

首轮测试仪应对母乳喂奶生物组织神经細胞系:研究方案工作人员首选了来人、鼠、仓鼠五个鱼类的三种组织神经細胞(HEK293T、K562、MEF、CHO),在空调温度下能 HEATag 箭头后搭配测序。决定回笼的 11447 个组织神经細胞中,85.66% 都能经过 HEATag 条状码更准配比到原鱼类,样例间交错空气污染特少,UMAP 聚类分析一下法分析一下更加是之间证明文件,HEATag 条状码与鱼类特女性朋友遗传基因组表现高不同。 然后接着,检验环境进一个步骤晋升:研究分析员体验在 4℃下标出优质体内部、在空调温度下标出甲醇放置体内部,恐怕直观标出体内部核。成果早已出众:所以环境下,样例量标价签与种群数据均更具最好的相应的性,分割准确度率超 95%。殊不知甲醇放置会导至稍微的转录本重叠废弃物,体内部核备制很有可能一少部分 RNA 损失,体内部类的参考文献标注成果早已与优质样例量保持着不一样,验证 HEATag 也可以标出有所差异加工环境下的實驗样例量。

Fig2: HEATag 可在不一样的情况下成功单内部转录组混样阐述

才可以标志喂母乳食草软体动物和海底无脊椎神经食草软体动物的原代细胞系

但若是说人体肿瘤细胞系测试软件是 “地基题”,那集体范例正是 “增添题”, 这部分范例虽然因人体肿瘤细胞内型比较复杂、氛围适宜性唯一性,变成箭头方法的 “突破点”,而 HEATag 恰恰舞在这部分 “突破点” 上体现出了的优势。

研究团队选择了大鼠和小鼠的睾丸组织结构,这类样本包含精原干细胞、精母细胞、精子细胞等多种类型,对标记一致性的要求极高。实验中,两种动物的睾丸用特异性 HEATag 条形码标记后混合测序,最终获得的 14663 个细胞这样不仅能被最准分辩,各种通常細胞型号的聚类分析的结果都精准可辨。

更令人惊喜的是HEATag对浮游微生物微生物的自适应性。HEATag能在海水的等渗溶液中标记新鲜的海洋动物细胞(如海月水母、大西洋海刺水母)。研究人员用人工海水稀释的HEATag 标记了水母和珊瑚的组织细胞后在 BD Rhapsody 平台测序,最终回收的 6452 个细胞中,HEATag 条型码与种群转录组更具较高不一性,不存在因高盐环镜以至于的 “标示不起作用”。后续对甲醇固定的海洋生物细胞测试结果显示,HEATag 在固定样本中的拆分效果优于新鲜样本。

Fig3: HEATag 可建立辅乳植物组织结构样例多大 scRNA-seq 阐述

Fig4: HEATag可满足剥好海域无脊梁骨生物重量 scRNA-seq 研究

HEATag与細胞的组合也不会使得转录组的有明显该变

对样本标记技术来说,“不影响样本本身的 RNA 特征” 是底线。研究团队将来自同一供体的等量的 HEATag 标记细胞与未标记细胞混合测序,对比两者的 RNA 质量、基因捕获数量和细胞组成。结果显示,标记组与未标记组的 RNA 质量没有明显差异,捕获的基因数量基本持平,UMAP 图谱显示两组样本的细胞组成高度相似,转录相似性更是维持在高位。无论是细胞簇的注释结果,还是不同细胞类型的基因回收数量,两组都几乎一致,没有出现 “标记导致的基因表达异常”。这意味着,HEATag在做完标示目标的还,就不会对前因后果的转录成分析诱发要素,确保了调查数据分析的最真实有效。

Fig5: HEATag没有决定样版的 RNA 呈现形式

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未来是什么可期

HEATag 能为单组织深入分析引来哪些?

HEATag 的市场价值,远止不住于 “消除图标相关问题”,它的轻松性和共通性,目前在为单细胞系钻研另存更高会性

从运用主要用途来

HEATag 能覆盖面从 “简单化更加分析分析分析”(如癌组建结构与常见组建结构、食用的药物处理与照表)到 “大占比分析分析”(如组建结构神经元图谱绘出、mtk量淘汰)的全标准所需。时间推移 PIP-seq、Stereo-cell 等复合型可括展技能的发展方向,HEATag 还能进十步完善单神经元分析分析的通量,助力器科研项目流程组织推进更重占比的项目流程。

从跨方向提升空间分析

HEATag 不单实用来转录组学,还能与表观基因遗传组学、脂肪酸质组学、面积组学等枝术水平依照,使用开发检索和寡核苷酸队列,HEATag 会简单融合不同于的组学流量,不后果预警驯服广度。互相,体系结构HEATag还会成长单上皮细胞糖组学研究分析枝术水平。

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合作协议新动态

拜谱生物学与陈凯客座教授促成首次合伙项目合作意向

比较适合留意的是,在 HEATag 科技出显现出不小操作实力的原型下,拜谱深海怪物已与北方深海實驗与建筑项目杭州實驗室(杭州)陈凯专家教授达到目标总体达成合作有意向。彼此策划致力于 HEATag 科技的行业化起飞、科学科学研究管理广泛应用等方法呈现长度警税,促进改革这一个低制造费、跨种类的单上皮細胞记号科技快些操作于实际情况科学科学研究管理画面,为比较多實驗室提高效率高、经济发展的单上皮細胞科学研究专用工具,注力科学科学研究管理岗位者在上皮細胞深海怪物学、深海深海怪物学、肠道疾病机制化等范畴授予比较多挑战
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